Drzewa filogenetyczne haplogrup chromosomu Y

Genetics

DNA Tutorials

Y-DNA haplogroups

MtDNA haplogroups

Regional history

Regional DNA Projects

One Family One World DNA Project

DNA Timeline

Autosomal DNA

Other DNA pages

Drzewa filogenetyczne haplogrup chromosomu Y
Eupedia > Genetyka > Filogeneza haplogrup chromosomu Y

Autor: Maciamo Hay.

Zawartość

Wprowadzenie

Drzewa na tej stronie reprezentują drzewo filogenetyczne haplogrupy chromosomu Y (Y-DNA) europejskiego i środkowo-wschodniego. Haplogrupa Y-DNA to grupa mężczyzn dzielących tę samą serię mutacji na ich chromosomie Y, które odziedziczyli po długiej linii wspólnych ojcowskich przodków. Kilka nowych mutacji, znanych jako SNP, zdarza się każde pokolenie i są przekazywane niezmienione do następnego pokolenia. Klasyfikacja nagromadzonego generowania SNP przez pokolenie umożliwia bardzo dokładne odtworzenie drzewa genealogicznego ludzkości, wykrycie wzorców w rozkładaniu wspólnych historycznych linii i odtworzenie historycznych migracji męskich linii.

Większość haplogrup na najwyższym poziomie (np. E1b1b, I1, J2, R1b) ma dziesiątki tysięcy lat, typowo wracając do okresu mezolitycznego lub paleolitu. Główne klady w obrębie haplogrupy często pasują do dużych grup etnicznych grupy językowe, które są zwykle wyświetlane z definicją SNP (np. E-V13, G2a-L497, J1-P58, R1a-M458, R1b-U106). Te główne klady zostały w większości utworzone w epoce neolitu lub brązu. Głębokie klady, również pokazane z definicją SNP (np. I1-L1302, I2a2a-Z78, J1-ZS227, N1c-M2783, R1b-M222), reprezentują młodsze linie, które powstały w epoce żelaza, w średniowieczu lub później. Im głębsza jest podkladą nowszego wspólnego przodka (=> patrz także Jak prześledzić nasze pochodzenie z DNA?). Klasyfikowanie SNP w porządku genealogicznym jest znane jako filogeneza.

Zauważ, że niektóre SNP mają więcej niż jedno nazwanie, znane jako aliasy (np. S21 i M405 są tą samą mutacją co U106), ponieważ firmy testujące, które je odkrywają, mają swoją własną nomenklaturę. Na przykład, SNP, które zaczynają się od M zostały zidentyfikowane przez Uniwersytet Stanford, seria L (np. L21) zostały znalezione przez DNA Family Tree w Teksasie, PF przez Università di Sassari we Włoszech, U (np. U152) przez University of Centralna Floryda, S (np. S21) przez EthnoAncestry, a CTS przez Welcome Trust Sanger Institute w Cambridge w Wielkiej Brytanii. Serie DF i Z pochodzą od różnych członków społeczności Genealogia genetyczna. Seria Y została zidentyfikowana przez Yfull.com.

Testy Y-DNA istnieją od wczesnych lat 2000, ale testy ograniczały się do pojedynczych SNP, po jednym na raz. Następnie rok po roku pojawiały się pakiety dziesiątek, a następnie setek, a następnie tysięcy SNP. Od 2014 r. Nowe komercyjne testy pozwoliły na sekwencjonowanie milionów SNP na raz, pokrywając większość chromosomu Y. Pozwoliło to na szybkie odkrycie dziesiątek tysięcy nowych SNP, co spowodowało, że drzewa filogenetyczne osiągnęły bardzo wysoką rozdzielczość, a czasami tylko kilka pokoleń oddziela najgłębsze odgałęzienia drzewa. Tak wysoka rozdzielczość byłaby niezręczna, dlatego postanowiliśmy ograniczyć głębokość do średniowiecza, kiedy powstały najbardziej nowoczesne grupy etniczne. Pionierem całego sekwencjonowania chromosomów Y były Full Genome Corprations, a SNP odkryte przez tę firmę zaczęły się od FGC. DNA Family Tree opracował podobny test, znany jako Big Y, którego SNP są oznaczone przez BY (=> patrz także Który test DNA wybrać?) .

Ważne jest, aby wiedzieć, że wiele haplogrup i podklady są zdefiniowane przez więcej niż jeden SNP. Linie paleolitu, które przez tysiące lat przeżywały poważne wąskie gardła populacyjne, czasami mają serię ponad stu definiujących SNP (np. Haplogrupy G i I1 mają ponad 300 określających SNP). Ogólnie mówiąc, liczba skumulowanych SNP między haplogrupą a jej bezpośrednią podkladą koreluje w przybliżeniu z liczbą pokoleń, które upłynęły. (Jest to nieco bardziej skomplikowane, ponieważ mutacje występują częściej na niektórych segmentach chromosomu Y niż na innych, i to powinno być brane pod uwagę również dla oceny wieku.) Ta strona ma na celu zapewnienie drzew, które są łatwe do wizualizacji , a co za tym idzie, tylko najbardziej popularny SNP zostanie pokazany. Czasami zostanie wyświetlony alias, jeśli oba są regularnie używane, a dwa równoważne SNP będą oddzielone ukośnikiem (np. U106/S21). Pełna lista mutacji znajduje się na stronie Yfull .com (obejmuje także oszacowanie wieku i TMRCA dla większości podklad) lub Duże drzewo (bardziej szczegółowe, ale tylko dla klady R1b-P312).